Le Conseil interconfessionnel de l'immigration du Manitoba a évolué après la Seconde Guerre mondiale lorsque les «personnes déplacées» ont dû déclarer leur appartenance religieuse pour entrer au pays. Diverses confessions ont cherché à aider les leurs à s'intégrer au Canada grâce à l'aide fournie aux points d'entrée. Avec des objectifs communs et un intérêt pour l'immigration et la politique d'immigration, une organisation de différentes églises a grandi ensemble.

En 1960, le Comité national interconfessionnel sur l'immigration a été formé avec des bureaux régionaux travaillant selon leurs propres directives.

Le Conseil régional du Manitoba, créé en 1968, apportait un soutien social et moral aux nouveaux arrivants grâce au travail de bénévoles. Le premier employé à temps partiel a été financé par des fonds du Département fédéral de l'emploi et de l'immigration.

De 1976 à 1979, cet employé a aidé les nouveaux arrivants à s'adapter au Manitoba. L'espace de bureau et les dépenses ont été fournis par les confessions religieuses. En 1980, l'église unie St. Andrew's Elgin a rencontré le MIIC pour répondre à l'afflux de réfugiés indochinois. Grâce à l'argent recueilli par les églises et à une subvention fédérale, un travailleur communautaire de l'Asie du Sud-Est a été embauché. En 1982 et 1983, des subventions fédérales et provinciales ont continué et élargi les services avec un deuxième travailleur communautaire et un coordonnateur.

En 2000, le Conseil interconfessionnel de l'immigration du Manitoba a signé une entente avec le gouvernement du Canada pour parrainer des réfugiés « liés à la famille » et soumettre des demandes de parrainage pour les membres de familles de réfugiés recommandés par des groupes constituants au sein de la communauté ethnoculturelle du Manitoba.

Aujourd'hui, les services comprennent des services parajuridiques aux demandeurs d'asile, une aide au parrainage familial, des informations et des conseils pour les réfugiés à l'étranger et une gamme complète de services (accueil, établissement) aux réfugiés assistés par le gouvernement et parrainés par le secteur privé.